Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTU1Q7Z7A3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms