Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms