Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6P435 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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