Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms