Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC93Q567U6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms