Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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