Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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