Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PCSK7Q16549 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PCSK7Q16549 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PCSK7Q16549 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PCSK7Q16549 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PCSK7Q16549 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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