Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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