Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms