Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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