Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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