Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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