Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms