Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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