Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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