Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERV3-1Q14264 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms