Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms