Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 REXO2-217ENST00000544507 641 ntTSL 36.34□□□□□ -1.395e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.465e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-203ENST00000538403 753 ntTSL 25.3□□□□□ -1.565e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-209ENST00000539788 626 ntTSL 35.07□□□□□ -1.65e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-219ENST00000546316 726 ntTSL 34.57□□□□□ -1.685e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.949e-20■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.284e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.474e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 POLR3D-204ENST00000518039 1202 ntTSL 225.17■■□□□ 1.622e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.863e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-202ENST00000464240 1830 ntTSL 221.87■■□□□ 1.092e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -03e-19■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-19■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.164e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.026e-15■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.524e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-208ENST00000529812 493 ntTSL 430.34■■■□□ 2.454e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-202ENST00000524723 837 ntTSL 528.39■■■□□ 2.144e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.674e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-206ENST00000527842 815 ntTSL 425.01■■□□□ 1.594e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-207ENST00000529765 801 ntTSL 225.01■■□□□ 1.594e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-210ENST00000531636 1395 ntTSL 224.15■■□□□ 1.464e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.017e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.437e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-205ENST00000527520 452 ntTSL 316.6■□□□□ 0.254e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-201ENST00000223084 1295 ntTSL 215.07■□□□□ 07e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EI24-203ENST00000527131 534 ntTSL 414.92□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-210ENST00000480956 1736 ntTSL 310.05□□□□□ -0.87e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.877e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-208ENST00000450169 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.917e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.147e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.247e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.387e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.421e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 219.39■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-222ENST00000551336 406 ntTSL 324.23■■□□□ 1.471e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-227ENST00000552902 869 ntTSL 224.2■■□□□ 1.461e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-223ENST00000551783 676 ntTSL 223.43■■□□□ 1.341e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-218ENST00000550856 1003 ntTSL 220.58■□□□□ 0.891e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-215ENST00000549242 518 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-212ENST00000548551 543 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-221ENST00000551258 966 ntTSL 512.21□□□□□ -0.451e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-208ENST00000547191 680 ntTSL 511.94□□□□□ -0.51e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPLP0-211ENST00000548495 651 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.086e-12■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.886e-12■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.093e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.873e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 NUTF2-208ENST00000587481 2608 nt11.28□□□□□ -0.63e-13■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-14■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PSMA7-204ENST00000442551 685 ntTSL 317.5■□□□□ 0.391e-14■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 IK-211ENST00000610522 737 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PHB-212ENST00000512041 694 ntTSL 311.49□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PHB-209ENST00000508009 451 ntTSL 57.53□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.665e-14■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.115e-14■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPL13A-204ENST00000472481 728 ntTSL 217.97■□□□□ 0.475e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.66e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.446e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 BAG6-259ENST00000464869 488 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.894e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.884e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.254e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 317.61■□□□□ 0.412e-7■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 221.18■□□□□ 0.982e-23■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.896e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.386e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 320.1■□□□□ 0.819e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 EEF1D-210ENST00000525223 610 ntTSL 316.36■□□□□ 0.219e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.825e-9■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.153e-10■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.079e-12■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 HMG20B-213ENST00000488973 2434 ntTSL 1 (best)21.13■□□□□ 0.979e-12■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-15■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-15■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.611e-15■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.71e-15■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 29.86□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 217.11■□□□□ 0.333e-18■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.72e-11■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 523.23■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 323.23■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 11.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 201.3 ms