Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHAF1BQ13112 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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