Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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