Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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