Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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