Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms