Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXM1Q08050 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms