Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms