Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms