Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBQ06643 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LTBQ06643 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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