Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms