Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms