Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms