Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms