Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms