Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VLDLRP98155 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VLDLRP98155 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VLDLRP98155 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms