Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms