Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms