Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIK1P57059 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIK1P57059 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIK1P57059 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIK1P57059 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIK1P57059 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIK1P57059 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIK1P57059 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIK1P57059 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms