Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms