Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms