Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms