Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARCN1P48444 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms