Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms