Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms