Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms