Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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