Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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