Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms