Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF30P17039 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF30P17039 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms