Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMDP11532 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMDP11532 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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