Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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